（1）從提供養(yǎng)分角度講：有機(jī)肥、化肥（單元素肥料、專(zhuān)用肥、復(fù)合肥）自身含有一定養(yǎng)分，可以直接供給農(nóng)作物吸收利用，而生物肥主要是通過(guò)微生物的生命活動(dòng)，以提高其它肥料利用率來(lái)達(dá)到肥效；
（2）從養(yǎng)分含量角度講：化肥養(yǎng)分含量高，有機(jī)肥含量低，而生物肥基本不含養(yǎng)分或微含養(yǎng)分；
（3）從肥效角度講：化肥見(jiàn)效快但作用時(shí)間短，養(yǎng)分利用率低，有機(jī)肥見(jiàn)效相對(duì)較慢但作用時(shí)間長(zhǎng)，養(yǎng)分利用率高。生物肥見(jiàn)效稍慢但作用時(shí)間長(zhǎng)久，只要微生物活著就有效果，微生物活性越強(qiáng)肥效越高；
（4）從無(wú)公害、食品安全、環(huán)保角度講：政府提倡、專(zhuān)家呼吁加大有機(jī)肥、生物肥投入量以減少化肥使用量，減少環(huán)境污染。同時(shí)還可以減弱硝酸鹽、亞硝酸鹽的轉(zhuǎn)化過(guò)程，使生產(chǎn)的食品更安全，達(dá)到無(wú)公害、綠色食呂標(biāo)準(zhǔn)。
1.改良土壤、培肥地力。有機(jī)肥料施入土壤后，有機(jī)質(zhì)能有效地改善土壤理化狀況和生物特性，熟化土壤，增強(qiáng)土壤的保肥供肥能力和緩沖能力，為作物的生長(zhǎng)制造良好的土壤條件。     2.增加產(chǎn)量、提高品質(zhì)。有機(jī)肥料含有豐富的有機(jī)物和各種營(yíng)養(yǎng)元素，為農(nóng)作物提供營(yíng)養(yǎng)。有機(jī)肥腐解后，為土壤微生物活動(dòng)提供能量和養(yǎng)料，促進(jìn)微生物活動(dòng)，加速有機(jī)質(zhì)分解，產(chǎn)生的活性物質(zhì)等能促進(jìn)作物的生長(zhǎng)和提高農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)。

    3.提高肥料的利用率。有機(jī)肥含有養(yǎng)分多但相對(duì)含量低，釋放緩慢，而化肥單位養(yǎng)分含量高，成份少，釋放快。兩者合理配合施用，相互補(bǔ)充，有機(jī)質(zhì)分解產(chǎn)生的有機(jī)酸還能促進(jìn)土壤和化肥中礦質(zhì)養(yǎng)分的溶解。有機(jī)肥與化肥相互促進(jìn)，有利于作物吸收，提高肥料的利用率。