（1）從提供養(yǎng)分角度講：有機肥、化肥（單元素肥料、專用肥、復合肥）自身含有一定養(yǎng)分，可以直接供給農作物吸收利用，而生物肥主要是通過微生物的生命活動，以提高其它肥料利用率來達到肥效；
（2）從養(yǎng)分含量角度講：化肥養(yǎng)分含量高，有機肥含量低，而生物肥基本不含養(yǎng)分或微含養(yǎng)分；
（3）從肥效角度講：化肥見效快但作用時間短，養(yǎng)分利用率低，有機肥見效相對較慢但作用時間長，養(yǎng)分利用率高。生物肥見效稍慢但作用時間長久，只要微生物活著就有效果，微生物活性越強肥效越高；
（4）從無公害、食品安全、環(huán)保角度講：政府提倡、專家呼吁加大有機肥、生物肥投入量以減少化肥使用量，減少環(huán)境污染。同時還可以減弱硝酸鹽、亞硝酸鹽的轉化過程，使生產的食品更安全，達到無公害、綠色食呂標準。
1.改良土壤、培肥地力。有機肥料施入土壤后，有機質能有效地改善土壤理化狀況和生物特性，熟化土壤，增強土壤的保肥供肥能力和緩沖能力，為作物的生長制造良好的土壤條件。     2.增加產量、提高品質。有機肥料含有豐富的有機物和各種營養(yǎng)元素，為農作物提供營養(yǎng)。有機肥腐解后，為土壤微生物活動提供能量和養(yǎng)料，促進微生物活動，加速有機質分解，產生的活性物質等能促進作物的生長和提高農產品的品質。

    3.提高肥料的利用率。有機肥含有養(yǎng)分多但相對含量低，釋放緩慢，而化肥單位養(yǎng)分含量高，成份少，釋放快。兩者合理配合施用，相互補充，有機質分解產生的有機酸還能促進土壤和化肥中礦質養(yǎng)分的溶解。有機肥與化肥相互促進，有利于作物吸收，提高肥料的利用率。